2026
Catalog of gut microbiota alterations associated with anticancer therapies across multiple cancer types
Kyoko Kurihara, Shunsuke A Sakai, Kentaro Sawada, Naoko Iida, Satoshi Horawasa, Takao Fujisawa, Yushiaki Nakamura, Shun-Ichiro Kageyama, Hideaki Bando, Takayuki Yoshino, Katsuya Tsuchihara, Riu Yamashita
bioRxiv 2026
がん治療薬による腸内細菌叢変化をがん種横断的に解析したプロジェクトです。薬剤の作用機序と腸内細菌叢変化の間に関連がみられました。
Catalog of gut microbiota alterations associated with anticancer therapies across multiple cancer types
Kyoko Kurihara, Shunsuke A Sakai, Kentaro Sawada, Naoko Iida, Satoshi Horawasa, Takao Fujisawa, Yushiaki Nakamura, Shun-Ichiro Kageyama, Hideaki Bando, Takayuki Yoshino, Katsuya Tsuchihara, Riu Yamashita
bioRxiv 2026
がん治療薬による腸内細菌叢変化をがん種横断的に解析したプロジェクトです。薬剤の作用機序と腸内細菌叢変化の間に関連がみられました。
Host innate immune response profiling reveals hidden viral infections across diverse animal species
Luca Nishimura†, Hiroaki Unno†, Kyoko Kurihara†, Mai Suganami, Junna Kawasaki, Spyros Lytras, Kaho Okumura, Edward C Holmes, Jumpei Ito, Kei Sato
bioRxiv 2026
東大医科学研究所でのインターンで手伝わせていただいたプロジェクトです。
Host innate immune response profiling reveals hidden viral infections across diverse animal species
Luca Nishimura†, Hiroaki Unno†, Kyoko Kurihara†, Mai Suganami, Junna Kawasaki, Spyros Lytras, Kaho Okumura, Edward C Holmes, Jumpei Ito, Kei Sato
bioRxiv 2026
東大医科学研究所でのインターンで手伝わせていただいたプロジェクトです。
2024
Multi-pass, single-molecule nanopore reading of long protein strands
Keisuke Motone, Daphne Kontogiorgos-Heintz, Jasmine Wee, Kyoko Kurihara, Sangbeom Yang, Gwendolin Roote, Oren E. Fox, Yishu Fang, Melissa Queen, Mattias Tolhurst, Nicolas Cardozo, Miten Jain, Jeff Nivala
Nature 2024
学部時代 (留学中) に取り組んだチームのプロジェクトです。Nanopore シーケンサーの波形からアミノ酸配列の解析が可能であることを示しました。アミノ酸分類機械学習モデル構築に向けた、ウェット実験による学習データの作成を担当しました。 (図: Motone et al. (2024) より引用)
Multi-pass, single-molecule nanopore reading of long protein strands
Keisuke Motone, Daphne Kontogiorgos-Heintz, Jasmine Wee, Kyoko Kurihara, Sangbeom Yang, Gwendolin Roote, Oren E. Fox, Yishu Fang, Melissa Queen, Mattias Tolhurst, Nicolas Cardozo, Miten Jain, Jeff Nivala
Nature 2024
学部時代 (留学中) に取り組んだチームのプロジェクトです。Nanopore シーケンサーの波形からアミノ酸配列の解析が可能であることを示しました。アミノ酸分類機械学習モデル構築に向けた、ウェット実験による学習データの作成を担当しました。 (図: Motone et al. (2024) より引用)
GINSA: an accumulator for paired locality and next-generation small ribosomal subunit sequence data
Eric Odle, Samuel Kahng, Siratee Riewluang, Kyoko Kurihara, Kevin C Wakeman
Bioinformatics 2024
学部時代 (北大) に手伝わせていただいたプロジェクトです。種名/属名からGBIFのOccurenceとSSU配列を紐づけて出力するツールです。(図: Odle et al. (2024) より引用)
GINSA: an accumulator for paired locality and next-generation small ribosomal subunit sequence data
Eric Odle, Samuel Kahng, Siratee Riewluang, Kyoko Kurihara, Kevin C Wakeman
Bioinformatics 2024
学部時代 (北大) に手伝わせていただいたプロジェクトです。種名/属名からGBIFのOccurenceとSSU配列を紐づけて出力するツールです。(図: Odle et al. (2024) より引用)