2026
Host innate immune response profiling reveals hidden viral infections across diverse animal species
Luca Nishimura†, Hiroaki Unno†, Kyoko Kurihara†, Mai Suganami, Junna Kawasaki, Spyros Lytras, Kaho Okumura, Edward C Holmes, Jumpei Ito*, Kei Sato* (* equal contribution)
bioRxiv 2026
東大医科学研究所でのインターンで手伝わせていただいたプロジェクトです。
Host innate immune response profiling reveals hidden viral infections across diverse animal species
Luca Nishimura†, Hiroaki Unno†, Kyoko Kurihara†, Mai Suganami, Junna Kawasaki, Spyros Lytras, Kaho Okumura, Edward C Holmes, Jumpei Ito*, Kei Sato* (* equal contribution)
bioRxiv 2026
東大医科学研究所でのインターンで手伝わせていただいたプロジェクトです。
2025
論文準備中...
第48回日本分子生物学会年会, 第84回日本癌学会学術総会, 2025年日本バイオインフォマティクス学会年会などで発表
現在取り組んでいるがん治療における腸内細菌叢のメタゲノム解析について、今後発表予定です。
論文準備中...
第48回日本分子生物学会年会, 第84回日本癌学会学術総会, 2025年日本バイオインフォマティクス学会年会などで発表
現在取り組んでいるがん治療における腸内細菌叢のメタゲノム解析について、今後発表予定です。
2024
Multi-pass, single-molecule nanopore reading of long protein strands
Keisuke Motone, Daphne Kontogiorgos-Heintz, Jasmine Wee, Kyoko Kurihara, Sangbeom Yang, Gwendolin Roote, Oren E. Fox, Yishu Fang, Melissa Queen, Mattias Tolhurst, Nicolas Cardozo, Miten Jain, Jeff Nivala
Nature 2024
学部時代 (留学中) に取り組んだチームのプロジェクトです。Nanopore シーケンサーの波形からアミノ酸配列の解析が可能であることを示しました。アミノ酸分類機械学習モデル構築に向けた、ウェット実験による学習データの作成を担当しました。 (図: Motone et al. (2024) より引用)
Multi-pass, single-molecule nanopore reading of long protein strands
Keisuke Motone, Daphne Kontogiorgos-Heintz, Jasmine Wee, Kyoko Kurihara, Sangbeom Yang, Gwendolin Roote, Oren E. Fox, Yishu Fang, Melissa Queen, Mattias Tolhurst, Nicolas Cardozo, Miten Jain, Jeff Nivala
Nature 2024
学部時代 (留学中) に取り組んだチームのプロジェクトです。Nanopore シーケンサーの波形からアミノ酸配列の解析が可能であることを示しました。アミノ酸分類機械学習モデル構築に向けた、ウェット実験による学習データの作成を担当しました。 (図: Motone et al. (2024) より引用)
GINSA: an accumulator for paired locality and next-generation small ribosomal subunit sequence data
Eric Odle, Samuel Kahng, Siratee Riewluang, Kyoko Kurihara, Kevin C Wakeman
Bioinformatics 2024
学部時代 (北大) に手伝わせていただいたプロジェクトです。種名/属名からGBIFのOccurenceとSSU配列を紐づけて出力するツールです。(図: Odle et al. (2024) より引用)
GINSA: an accumulator for paired locality and next-generation small ribosomal subunit sequence data
Eric Odle, Samuel Kahng, Siratee Riewluang, Kyoko Kurihara, Kevin C Wakeman
Bioinformatics 2024
学部時代 (北大) に手伝わせていただいたプロジェクトです。種名/属名からGBIFのOccurenceとSSU配列を紐づけて出力するツールです。(図: Odle et al. (2024) より引用)